Natsume Takashi kiskora óta szellemeket lát – jókat is, rosszakat is. Különleges képessége azonban teher számára, hiszen elszigeteli őt az átlagos emberektől és a szellemektől egyaránt. Szülei halála óta rokonai kézről-kézre adják, míg végül vidékre kerül egy házaspárhoz, ahol egyre többször gyűlik meg a baja a rá támadó szellemekkel. Az egyik nap – éppen egy youkai elől menekülve – találkozik egy macska formájú, hősünk által csak Nyanko-senseinek keresztelt lénnyel, aki elmondja neki: nagymamája anno szintén itt élt egy ideig, szintén látta a szellemeket és volt egy könyve, amibe a szellemek neveit gyűjtötte össze. A Barátok Könyve címet viselő könyvecske meglepően nagy hatalommal bír, ezért Takashi úgy dönt, hogy visszaadja a benne lévő neveket a tulajdonosaiknak. Önként vállalt küldetése nyomán feltárul előtte a szellemvilág és szembesülve saját félelmeivel egyre inkább képessé válik arra, hogy megnyíljon mások előtt és felvállalja saját érzelmeit.